Первый слайд презентации: Как москвичи создают атлас флоры Москвы?
Алексей Серегин, Биологический факультет МГУ
Слайд 4: Сканирование образцов Гербария Главного ботанического сада РАН
отсканировано 49 694 образца из Москвы и Подмосковья (т.н. московский отдел Гербария ГБС РАН) 600 dpi, TIFF+JPEG метаданные на момент сканирования включали ID образца и название вида https://plant.depo.msu.ru/ 4
Слайд 5: Материалы: библиотека изображений
Москва и Подмосковье Гербарий МГУ: 80 670 образцов ( отсканировано ранее, 300 dpi) Гербарий ГБС РАН: 49 694 образцов ( отсканировано по проекту, 600 dpi) ИТОГО: 130 364 образца 5
Слайд 6: Краткие метаданные: коллектор и дата
Гербарий МГУ 74 527 образцов (92%) Гербарий ГБС РАН 38 374 образца (77%) Этикетки двух образцов из Гербария МГУ, собранные М.И. Назаровым 16.08.1924 в Москве у Даниловской мануфактуры https://plant.depo.msu.ru/ 6
Слайд 7: Геопривязка : установление координат мест сбора
Гербарий МГУ 41 768 образцов (52 %) Гербарий ГБС РАН 23 905 образцов (48 %) Облако точек сборов Н.И. Кузнецова из окрестностей метеостанции Гельтищево (1920-е гг.) Этикетки одного из сборов Н.И. Кузнецова из окрестностей метеостанции Гельтищево (1925 г., «по берегу ручья Пыхалка ») https://plant.depo.msu.ru/ 7
Слайд 8: Использование OCR для быстрого поиска образцов из Москвы
OCR - майнинг данных производит ПО Tesseract ( версия 4) https://plant.depo.msu.ru/ 8
Слайд 10: Портал «Флора Москвы» в Цифровом гербарии МГУ: один из 38 299 образцов
https ://moscow.depo.msu.ru / 10
Слайд 11: Образец» vs. «Наблюдение»
Все данные: max. 125,640,610 Гербарные образцы : max. 835,779 (за 198 3 год) Источник: gbif.org 11
Слайд 13: Добро пожаловать на iNaturalist !
29 декабря 2018 г. мы создали портал «Флора Москвы» на iNaturalist : 892 фотонаблюдения 299 видов 140 наблюдателей iNaturalist – международная платформа для создания и управления онлайн-проектами по биоразнообразию, где каждая запись подкреплена фотографией или аудиозаписью https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-moscow 13
Слайд 17: Ну почему только Москва?»
12 января 2019 г. заработал портал «Флора России» на iNaturalist : 8 445 фотонаблюдений 1 292 вида 745 наблюдателей По аналогии с набравшим популярность проектом «Флора Москвы» в первые дни 2019 г. мы создали еще 84 региональных проекта для каждого региона России, которые были объединены в единый портал «Флора России ». https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia 17
Слайд 19
8.02. 2019 22.05.2024 https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-moscow
Слайд 22
Сообщество наблюдателей: 5 008 Сообщество экспертов: 2 629 Сообщество подписчиков: 262 “Core Team” 22. 05. 2024
Слайд 25: Все электронные данные по сосудистым растениям
22. 05. 2024 Все электронные данные по сосудистым растениям
Слайд 27
22. 05. 2024 https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-moscow https://moscow.depo.msu.ru/
Слайд 28: Документация охраняемых растений
Красная книга России. Красная книга Москвы.
Слайд 40: Ambrosia artemisiifolia L. в России: прогресс
Все данные в GBIF : 1118 точек, в т.ч. Только 2019–202 1 : 839 точек, в т.ч. 760 точек ( 68 %) из iNaturalist 729 точек (8 7 %) из iNaturalist 22. 1 1.2021
Слайд 41: Натурализация Lonicera nigra ( жимолости чёрной ) близ Санкт-Петербурга
80 точек
Слайд 43
7 точек 2 1. 1 1.2021 Натурализация Clematis terniflora ( ломоноса трёхцветкового ) близ Новосибирска
Слайд 49: Pedicularis palustris L. (мытник болотный) в Подмосковье: регресс
Данные гербариев: 122 точки Данные iNaturalist : 7 находок (4 точки ) Источники : https://www.inaturalist.org/; https://plant.depo.msu.ru/ 18 Jan 2021
Слайд 50: Документация вымирания: Lycopodium clavatum L. ( плаун булавовидный)
47 гербарных образцов 9 точек на iNaturalist 50
Слайд 51: Документация вымирания: Lycopodium clavatum L. ( плаун булавовидный)
51
Слайд 56
Van Horn G. et al. The iNaturalist species classification and detection dataset // Proceedings of the IEEE conference on computer vision and pattern recognition. – 2018. – С. 8769-8778.
Слайд 68: Критерии включения видов в модель
Вот все формальные пороги для новых видов : ранг вида (гибриды, подвиды и разновидности не включаются) минимум 100 фото минимум 60 наблюдений 50% фото имеют определение сообщества не более 5 фото из одного наблюдения
Слайд 70
Allium angulosum L. Allium scapo nudo ancipiti, foliis linearibus canaliculatis subtus subangulatis, umbella fastigiata Лук со стеблем голым обоюдоострым, листьями линейными желобчатыми снизу почти угловатыми, зонтиком равновысоким « Species Plantarum » (Linnaeus, 1753)
Слайд 73
Май - Июнь «увиденные поблизости» Июль Находки Август Находки Сентябрь Находки Октябрь «увиденные поблизости» Ноябрь -
Слайд 75
- - - - - - «увиденные поблизости» «увиденные поблизости» «увиденные поблизости» - - «увиденные поблизости» находки «увиденные поблизости» - - «увиденные поблизости» «увиденные поблизости» «увиденные поблизости» - - - - - - 57 ° 56 ° 55 ° 54 ° 53 ° 58° с.ш. 35 ° 36 ° 37 ° 38 ° 39 ° в.д.
Слайд 82
Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные Рядом (по умолчанию). Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом. Вариант 3. Точка не указана. 16.10.2021
Слайд 84
Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию). Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом. Вариант 3. Точка не указана. 20.1 1.2021
Слайд 86
Вариант 1. Точка указана. Убраны виды, не отмеченные рядом (по умолчанию). Вариант 2. Точка указана. Показаны все виды, в т.ч. не отмеченные рядом. Вариант 3. Точка не указана. 20.11.2021
Слайд 89
22.07.2024 200M iNaturalist observations in graphs Source: https:// www.inaturalist.org/blog/97048
Слайд 90: Russia on iNaturalist : key metrics
High proportion of vascular plants Russia : 53. 7 % World : 39.1% High proportion of free licences (CC0, CC-BY, CC-BY-NC) suitable for GBIF Russia : 91.4% World : 72. 1 % High proportion of Research-Grade observations Russia : 81.4% World : 62.6% Very high number of observations per observer Russia : 189.3 obs. World : 61.2 obs. High proportion of observations exported to GBIF Russia : 73.2% World : 4 5. 6 % 8. 07.202 4