Пименов А.В. Тема: «Код ДНК. Транскрипция». Задачи: Рассмотреть основные свойства генетического кода; Изучить особенности транскрипции у эукариот.
Важнейшее свойство живых организмов — обмен веществ. Любой живой организм — открытая система, которая потребляет из окружающей среды различные вещества и использует их в качестве строительного материала, или как источник энергии и выделяет в окружающую среду продукты жизнедеятельности и энергию. Совокупность реакций обмена веществ, протекающих в организме, называется метаболизмом, состоящим из взаимосвязанных реакций ассимиляции (пластического обмена, анаболизма) и реакций диссимиляции (энергетического обмена, катаболизма). Общая характеристика обмена веществ
Эти две группы реакций взаимосвязаны, реакции биосинтеза невозможны без энергии, которая выделяется в реакциях энергетического обмена, реакции диссимиляции не идут без ферментов, образующихся в реакциях пластического обмена. Для поддержания различных процессов жизнедеятельности, например: для движения, для биосинтеза различных органических соединений; для поглощения веществ — организму необходима энергия. Одна группа организмов ( фотоавтотрофы ) использует солнечную энергию; вторая группа ( хемоавтотрофы ) использует энергию, выделяющуюся при окислении неорганических веществ; Общая характеристика обмена веществ
Третья группа организмов ( хемогетеротрофы ) окисляет органические вещества и использует выделяющуюся при этом энергию. Если организмы в зависимости от условий ведут себя как авто– либо как гетеротрофы, то их называют миксотрофами. Метаболизм авто– и гетеротрофов различается. В качестве источника углерода автотрофы используют неорганические вещества (СО 2 ), а гетеротрофы — органические. Различны и источники энергии : у автотрофов — энергия солнечного света или энергия, выделяющаяся при окислении неорганических соединений, у гетеротрофов — энергия окисления органических веществ. Общая характеристика обмена веществ
К какой группе организмов по типу использования энергии относятся: Бактерии-сапротрофы? Зеленые бактерии? Цианобактерии? Грибы? Животные? Растения? Общая характеристика обмена веществ
В каждой клетке синтезируется несколько тысяч различных белковых молекул. Белки недолговечны, время их существования ограничено, после чего они разрушаются. Информация о последовательности аминокислот в белковой молекуле закодирована в виде последовательности нуклеотидов в ДНК. Код ДНК.
Итак, последовательность нуклеотидов каким-то образом кодирует последовательность аминокислот. Все многообразие белков образовано из 20 различных аминокислот, а нуклеотидов в составе ДНК — 4 вида. Если предположить, что один нуклеотид кодирует одну аминокислоту, то 4 нуклеотидами можно закодировать 4 аминокислоты. Код ДНК. Если 2 нуклеотида кодируют одну аминокислоту, то количество кодируемых кислот возрастает до 16 (4 2 ). Значит, код ДНК должен быть триплетным. Было доказано, что именно три нуклеотида кодируют одну аминокислоту, в этом случае можно будет закодировать 4 3 — 64 аминокислоты. А так как аминокислот всего 20, то некоторые аминокислоты должны кодироваться несколькими триплетами.
Код ДНК. Свойства кода Триплетность. Каждая аминокислота кодируется триплетом нуклеотидов – кодоном. Однозначность. Кодовый триплет, кодон, соответствует только одной аминокислоте. Вырожденность (избыточность). Одну аминокислоту могут кодировать несколько (до шести) кодонов.
Универсальность. Генетический код одинаков, одинаковые аминокислоты кодируются одними и теми же триплетами нуклеотидов у всех организмов Земли. Неперекрываемость. Последовательность нуклеотидов имеет рамку считывания по 3 нуклеотида, один и тот же нуклеотид не может быть в составе двух триплетов. (Жил был кот тих был сер мил мне тот кот); Код ДНК. Свойства кода
Наличие кодона- инициатора и кодонов-терминаторов. Из 64 кодовых триплетов 61 кодон — кодирующие, кодируют аминокислоты, а 3 — бессмысленные, не кодируют аминокислоты, терминирующие синтез полипептида при работе рибосомы (УАА, УГА, УАГ). Кроме того, есть кодон — инициатор (метиониновый), с которого начинается синтез любого полипептида. Код ДНК. Свойства кода
Транскрипция Реакции матричного синтеза – особая категория химических реакций, происходящих в клетках живых организмов. Во время этих реакций происходит синтез полимерных молекул по плану, заложенному в структуре других полимерных молекул-матриц. На одной матрице может быть синтезировано неограниченное количество молекул-копий. К этой категории реакций относятся репликация, транскрипция, трансляция и обратная транскрипция (образование на РНК ДНК). Центральная догма молекулярной биологии: ДНК РНК белок.
Транскрипция
Особенностями строения гена эукариот являются: наличие достаточно большого количества регуляторных элементов (РЭ) ; мозаичность (чередование кодирующих участков с некодирующими); наличие экзонов (Э) – участков гена, несущих информацию о строении полипептида и интронов (И), не несущих такой информации. Число экзонов и интронов различных генов разное, экзоны чередуются с интронами, общая длина интронов может превышать длину экзонов в два и более раз. Гены эукариот могут кодировать полипептиды, тРНК, рРНК, есть регуляторные участки. Транскрипция
Перед первым экзоном и после последнего экзона находятся нуклеотидные последовательности, называемые соответственно лидерной (ЛП) и трейлерной последовательностью (ТП). Лидерная и трейлерная последовательности, экзоны и интроны образуют единицу транскрипции. Транскрипция
Транскрипция – синтез РНК на матрице ДНК. РНК-полимераза II может присоединиться только к промотору, который находится на 3'-конце матричной цепи ДНК, и двигаться только от 3'- к 5'-концу этой матричной цепи ДНК. Синтез иРНК происходит на одной из двух цепочек ДНК в соответствии с принципами комплементарности и антипараллельности от 5 '- к 3 '-концу. Строительным материалом и источником энергии для транскрипции являются рибонуклеозидтрифосфаты (АТФ, УТФ, ГТФ, ЦТФ). Транскрипция
Сколько нуклеотидов кодируют полипептид из 51 аминокислоты? 153 Какой триплет в молекуле иРНК соответствует кодовому триплету АТГ в молекуле ДНК? УАЦ Какой триплет ДНК матричной цепи соответствует кодону АСА иРНК? ТГТ Транскрипция
Транскрипция
Каким кодоном кодируется аминокислота триптофан на иРНК? Какой триплет ДНК несет информацию об этой аминокислоте? Кодон иРНК: 5 ’ – УГГ – 3 ’ Кодон ДНК: 3’ – A ЦЦ – 5’ Транскрипция
Триплетность генетического кода. Поясните это свойство. Каждая аминокислота кодируется триплетом нуклеотидов – кодоном. Однозначность генетического кода. Поясните это свойство. Кодовый триплет, кодон, соответствует только одной аминокислоте. Вырожденность генетического кода. Поясните это свойство. Одну аминокислоту могут кодировать несколько (до шести) кодонов. Универсальность генетического кода. Поясните это свойство. Генетический код одинаков, одинаковые аминокислоты кодируются одними и теми же триплетами нуклеотидов у всех организмов Земли. Неперекрываемость генетического кода. Поясните это свойство. Последовательность нуклеотидов имеет рамку считывания по 3 нуклеотида, один и тот же нуклеотид не может быть в составе двух триплетов. На ДНК могут быть закодированы: Полипептиды, рРНК, тРНК. Подведем итоги:
Сколько кодонов кодируют 20 видов аминокислот? Какие кодоны находятся в начале иРНК и в ее конце? Из 64 кодовых триплетов 61 кодон — кодирующие, кодируют аминокислоты, а 3 — бессмысленные, не кодируют аминокислоты, терминирующие синтез полипептида при работе рибосомы (УАА, УГА, УАГ). Кроме того, есть кодон — инициатор (метиониновый), с которого начинается синтез любого полипептида. Что такое промотор? Перед геном находится промотор – последовательность нуклеотидов, с которой соединяется РНК-полимераза. Что такое транскрипция? Транскрипция – синтез РНК на матрице ДНК. В каком направлении движется РНК-полимераза? В каком направлении происходит образование иРНК? РНК-полимераза может присоединиться только к промотору, который находится на 3'-конце матричной цепи ДНК, и двигаться только от 3'- к 5'-концу этой матричной цепи ДНК. Подведем итоги:
В результате транскрипции образуется «незрелая» иРНК (пре-иРНК), которая проходит стадию созревания или процессинга. Транскрипция
Процессинг включает в себя: КЭПирование 5'-конца; полиаденилирование 3'-конца (присоединение нескольких десятков адениловых нуклеотидов); сплайсинг (вырезание интронов и сшивание экзонов). В зрелой иРНК выделяют КЭП, транслируемую область (сшитые в одно целое экзоны), нетранслируемые области (НТО) и полиА «хвост». Возможен альтернативный сплайсинг, при котором вместе с интронами вырезаются и экзоны. При этом с одного гена могут образовываться разные белки. Таким образом, утверждение – «Один ген – один полипептид» – неверно. Транскрипция
Процессинг включает в себя: КЭПирование 5'-конца; полиаденилирование 3'-конца (присоединение нескольких десятков адениловых нуклеотидов); сплайсинг (вырезание интронов и сшивание экзонов). В зрелой иРНК выделяют КЭП, транслируемую область (сшитые в одно целое экзоны), нетранслируемые области (НТО) и полиА «хвост». Возможен альтернативный сплайсинг, при котором вместе с интронами вырезаются и экзоны. При этом с одного гена могут образовываться разные белки. Таким образом, утверждение – «Один ген – один полипептид» – неверно.
Транскрипция
Транскрипция
Транслируемая область начинается кодоном-инициатором, заканчивается кодоном-терминатором. НТО содержат информацию определяющую поведение РНК в клетке: срок «жизни», активность, локализацию. Транскрипция и процессинг происходят в клеточном ядре. Зрелая иРНК приобретает определенную пространственную конформацию, окружается белками и в таком виде через ядерные поры транспортируется к рибосомам; иРНК эукариот, как правило, моноцистронны (имеют только один кодон терминатор). Транскрипция
Согласно гипотезе «билетиков», поли(А) разрушается 3 / - РНКазой не постоянно, а после завершения каждой рибосомой трансляции от нее отщепляется 10-15 нуклеотидов. Когда же в этом фрагменте остается около 50 нуклеотидов, мРНК становится доступной для РНКаз и быстро разрушается. Транскрипция
На ДНК кроме иРНК образуются тРНК и рРНК. тРНК отвечают за транспорт аминокислот к месту трансляции – к рибосомам, рибосомные – входят в состав рибосом. тРНК – имеют небольшие размеры – порядка 76-85 нуклеотидов, их около 10% от всех видов РНК в клетке (иРНК – до 30 000 нуклеотидов, 5%; рРНК – 3000-5000 нуклеотидов, 85%). тРНК имеет три петли, на антикодоновой находится антикодон, комплементарный кодону определенной аминокислоты. К 3 / - концу (акцепторный участок, CCA ) присоединяется аминокислота. Транскрипция
При трансляции кодоны иРНК считываются с 5 / -конца, антикодоны тРНК располагаются комплементарно и антипараллельно и считываются с 3 / - к 5 / -концу. Например, антикодон метиониновой тРНК читается UAC. Транскрипция
На матричной цепи ДНК образуется антикодон тРНК. Назовите его. А UG. Как узнать, какую аминокислоту транспортирует данная тРНК? По антикодону тРНК определить кодон иРНК, по кодону иРНК – аминокислоту. Определите. Антикодон тРНК AUG Кодон иРНК UAC Аминокислота тирозин
Антикодон тРНК ААУ. Определите аминокислоту, которую транспортирует данная тРНК. Какими кодовыми триплетами на иРНК и матричной ДНК закодирована данная аминокислота? Антикодон тРНК ААУ Кодон иРНК УУА, аминокислота – лейцин, на ДНК – ААТ
Поясните рисунок
Что такое альтернативный сплайсинг? Каково значение НТО? Поясните рисунок
Поясните рисунок
Поясните рисунок
